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프로젝트 설명

Py_ContigViewer is a contig viewer, a stand alone
cross-platform desktop application that uses CAP3
alignments to graphically display and validate
candidate SNPs and InDels. It also simplifies PCR
oligo design in an interactive mode. The extended
mode provides the display of BLAST hits of
annotated sequences with intron positions for the
selected contig. Py_ContigViewer works in
conjunction with DIS (Deletion, Insertion,
Substitution) SNP discovery pipeline at
http://www.atgc.org/SNP_Discovery/.

System Requirements

System requirement is not defined
Information regarding Project Releases and Project Resources. Note that the information here is a quote from Freecode.com page, and the downloads themselves may not be hosted on OSDN.

2004-04-20 05:23
Apr_19_2004

이 릴리스에는 투명한 데이터 PerlPrimer 프로그램에 네트워크 소켓을 통해 전송을 제공합니다. 없기 때문에 더 이상 필요 "를 실행하기는"/ "로 열기"대화 상자가있다 그것은 oligo 설계를 단순화한다. 또한, 디스플레이 매개 변수의 구성 파일을 사용하여 설정하실 수있습니다.
Tags: Minor feature enhancements
This release provides transparent data transfer to the PerlPrimer program via a network socket. It simplifies oligo design because there is no longer a need to run "save as" / "open as" dialogs. It also allows configuration of display parameters using a config file.

2004-03-26 05:50
Mar_25_2004

이 버전은 직접 PerlPrimer 프로그램에 의해 사용될 수있습니다 oligo 디자인을 위해 선택한 영역에 대한 정보와 FASTA 형식의 출력 파일을 생성합니다. 문자열에 대한 검색 기능이 개선되었습니다 공감대 시퀀스에 대한 GC %의 콘텐츠를 표시하는 구현되었습니다.
Tags: Minor feature enhancements
This version generates output files in FASTA format with
information about selected regions for oligo design that
can be used directly by the PerlPrimer program. The
search function for substrings was improved, and
displaying of GC% content for consensus sequences was
implemented.

2004-03-16 20:25
Mar_12_2004

Tags: Initial freshmeat announcement

Project Resources